De Lyme-bacterie wordt bijna altijd overgedragen door een beet van een geïnfecteerde teek. De teek hecht zich vast in de huid en zuigt zich vol met bloed. Als de teek is geïnfecteerd, dan kunnen de Lyme-bacteriën worden overgedragen naar de mens.
Ook kunnen zwangere vrouwen die geïnfecteerd zijn met de Lyme, de ziekte overdragen op het ongeboren kind.
Andere besmettingswegen zijn (mogelijk, maar dus nog niet wetenschappelijk aangetoond) zijn borstvoeding, menselijk en dierlijk contact, bloedzuigende insecten (muggen, vliegen, vlooien), bloedtransfusies en transplantaties.